企業支援計劃是中醫藥發展基金其中一主要範疇，此計劃主要提供配對資助予個別從業員或廠商等以協助本地中醫藥發展。企業支援計劃下分為4個項目，包括: 「中醫藥從業員培訓及改善中醫診所設施資助計劃」，「中成藥生產質量管理系統優化資助計劃」，「中成藥註冊支援計劃」及「改善倉庫管理、物流和服務資助計劃」。